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人工智能顯神威,一個(gè)半小時(shí)篩選出能殺死超級(jí)細(xì)菌的新型抗生素

   日期:2023-05-29     來(lái)源:IT之家     評(píng)論:0    
   IT之家5月28日消息,據(jù)《自然化學(xué)生物學(xué)》雜志發(fā)表的研究結(jié)果顯示,加拿大和美國(guó)的研究人員利用AI技術(shù),發(fā)現(xiàn)了一種名為abaucin的強(qiáng)效抗生素。這種抗生素需要進(jìn)一步的測(cè)試,才能用于臨床治療。研究人員表示,AI技術(shù)能夠大大提高智能和效率,解決新藥開(kāi)發(fā)中的難題。
 
  抗生素是用來(lái)殺死細(xì)菌的藥物,然而近幾十年來(lái)一直缺乏新型抗生素的開(kāi)發(fā),導(dǎo)致細(xì)菌類(lèi)疾病變得越來(lái)越難以治療,因?yàn)樗鼈冞M(jìn)化出了對(duì)現(xiàn)有藥物的抗性。據(jù)估計(jì),每年有超過(guò)一百萬(wàn)人死于對(duì)抗生素治療的耐藥性感染。

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  研究人員將目標(biāo)鎖定在一種最棘手的細(xì)菌種類(lèi)——鮑曼不動(dòng)桿菌(Acinetobacter baumannii),這種細(xì)菌能夠感染傷口和引起肺炎,是世界衛(wèi)生組織列出的三種“嚴(yán)重”威脅之一。據(jù)IT之家了解,這種細(xì)菌能夠抵抗多種抗生素,能夠存活在物體表面和醫(yī)療設(shè)備上。
 
  來(lái)自麥克馬斯特大學(xué)(McMaster University)的喬納森?斯托克斯(Jonathan Stokes)博士將這種細(xì)菌稱(chēng)為“公敵第一”,因?yàn)樗?ldquo;非常常見(jiàn)”,并且經(jīng)常發(fā)現(xiàn)它“對(duì)幾乎所有抗生素都有耐藥性”。
 
  為了找到新型抗生素,研究人員首先要訓(xùn)練AI。他們選取了數(shù)千種已知確切化學(xué)結(jié)構(gòu)的藥物,并手動(dòng)測(cè)試它們對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌的作用,看哪些能夠減慢或殺死它。這些信息被輸入到AI中,讓它學(xué)習(xí)哪些化學(xué)特征能夠攻擊這種難纏的細(xì)菌。
 
  然后,他們讓AI在一個(gè)包含6680種未知效果的化合物列表中進(jìn)行篩選。結(jié)果顯示,AI只用了一個(gè)半小時(shí)就生成了一個(gè)候選名單。研究人員在實(shí)驗(yàn)室中測(cè)試了名單中的240種化合物,并發(fā)現(xiàn)了九種潛在的抗生素,其中之一就是強(qiáng)效的抗生素abaucin。
 
  實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)表明,abaucin能夠治療小鼠的感染傷口,并且能夠殺死來(lái)自患者的鮑曼不動(dòng)桿菌樣本。研究人員稱(chēng),下一步是在實(shí)驗(yàn)室中完善這種藥物,然后進(jìn)行臨床試驗(yàn),預(yù)計(jì)第一批AI抗生素可能要到2030年才能被開(kāi)出處方。
 
  奇怪的是,這種實(shí)驗(yàn)性的抗生素對(duì)其他種類(lèi)的細(xì)菌沒(méi)有任何效果,只對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌有效。許多抗生素會(huì)不加區(qū)分地殺死細(xì)菌,研究人員認(rèn)為,abaucin的精準(zhǔn)性會(huì)使細(xì)菌耐藥性的出現(xiàn)更加困難,并且可能帶來(lái)更少的副作用。
 
  理論上,AI可以篩選數(shù)千萬(wàn)種潛在的化合物,這對(duì)人工來(lái)說(shuō)是不切實(shí)際的。“AI提高了我們發(fā)現(xiàn)這些我們迫切需要的新型抗生素的速度,在理想情況下還能降低成本。”斯托克斯博士說(shuō)。
 
  來(lái)自麻省理工學(xué)院的詹姆斯?柯林斯(James Collins)教授說(shuō):“這一發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步支持了我們可以利用AI來(lái)加速并擴(kuò)大我們尋找新型抗生素的范圍。”他補(bǔ)充說(shuō):“我很高興看到這項(xiàng)工作表明,我們可以利用AI來(lái)幫助對(duì)抗諸如鮑曼不動(dòng)桿菌等難以處理的病原體。”
 
  參考文獻(xiàn):
 
  https://www.nature.com/articles/s41589-023-01349-8
 
 
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